2019年开始合作,采用“学校-基金会-企业”三方联合共建模式建设NGS实训室,形成“平台+资金+技术”合作模式,有效解决高校高水平实训室建设的的资金、技术问题等。
3 NGS实训室建设
3.1 NGS实训室设计依据
依据GB19489-2008《实验室生物安全通用要求》、WS233-2017《病原微生物实验室生物安全通用准则》、GB50346-2011《生物安全实验室建筑技术规范》、《临床基因扩增实验室管理暂行办法》等相关实验室建设文件精神[7-10],遵照各区独立、单一流向、因地制宜、方便工作的原则,按照教学环境职业化的要求,对NGS实训室进行设计,如图1所示。
图1 NGS实训室分区示意图
3.2 实训室区域设置及专业设施配置
NGS实训室总建设面积约为140m2,按照基因测序操作流程建设试剂准备区、样本与文库制备区、文库扩增与检测区、测序分析区4个独立分区。不同分区根据功能不同所占面积比例不同,配置必备的专业化仪器设备,如图2所示。
(1)试剂准备区
功能:试剂的配制、分装和存储等操作区。主要仪器配置:冰箱、生物安全柜、纯水仪、高速冷冻离心机、涡旋振荡器、微量移液器等。
(2) 样本与文库制备区
功能:主要开展核酸的提取、浓度测定和文库的构建等岗位项目。主要仪器配置:冰箱、生物安全柜、核酸自动提取仪、核酸定量仪、PCR仪、磁力架、高速冷冻离心机、涡旋振荡器、微量移液器等。
图2 NGS实训室实景图
(3)文库扩增与检测区
功能:主要进行杂交捕获产物PCR扩增富集和文库片段分析。主要仪器配置:冰箱、核酸定量仪、PCR仪、磁力架、电泳仪、高速冷冻离心机、涡旋振荡器、微量移液器等。
(4)测序分析区
功能:主要进行文库的上机测序,分析高通量测序仪得出的数据并出具报告。主要仪器配置:MGISEQ-200基因测序仪、电脑及数据服务器等。
3.3企业文化氛围营造
整个NGS实训室按照企业真实工作环境和职业氛围进行布置,例如各分区配备不同颜色的工作服;张贴企业安全标语、基因测序流程、安全操作规程、岗位职责、仪器设备管理条例等;悬挂体现企业精神、专业精神的标语等,最大化重现企业真实工作环境,营造实训室的企业文化氛围,引导学生职业素养的养成。
4 NGS实训室功能定位
校企共建NGS实训室,服务药品生物技术品牌专业及专业群建设,打造集实践教学、产学研服务、职业培训、和科学普及于一体的开放式合作型平台,